De fylogenese komt overeen met de fylogenetische ontwikkeling van een soort levend wezen. Het gaat dus om de procesmatige ontwikkelingsgeschiedenis van mensen en andere soorten en de kenmerken die deze soorten onderscheiden. Studies van fylogenese komen overeen met een analyse van individuele of meerdere kenmerken en worden vaak samengevat in stambomen. Fylogenetische analyses kunnen ook worden uitgevoerd voor individuele ziekten.
Wat is fylogenese?
Fylogenese komt overeen met de fylogenetische ontwikkeling van een soort levend wezen.Biologie gebruikt de term fylogenese om de fylogenetische ontwikkeling van een reeks levende wezens en hun verwantengroepen te beschrijven. Soms omvat de term ook de progressieve ontwikkeling van individuele kenmerken in de loop van de ontwikkelingsgeschiedenis en omvat in dit geval voornamelijk verbanden van evolutie.
Fylogenie moet worden onderscheiden van ontogenie, die verwijst naar de ontwikkeling van individuele individuen binnen een bepaalde soort. Een fylogenetische reconstructie voor een bepaalde groep vindt altijd plaats door hun erfelijke kenmerken te onderzoeken. Deze analyse van kenmerken wordt zowel op de levende soorten als op zijn fossiele vertegenwoordigers uitgevoerd.
De reconstructie van een fylogenese heeft tot doel de relaties tussen de individuele soorten te verduidelijken en maakt ook de reconstructie van fylogenetische natuurlijke systemen met de taxonomie mogelijk. Fylogenetische relaties worden vaak zichtbaar gemaakt door middel van een weergave in de stamboom.
Functie en taak
Er bestaan fylogenetische studies voor een groot aantal holistische en individuele kenmerken van mensen. Zo zijn er nu fylogenetische taalversies die specifiek betrekking hebben op de ontwikkeling van taal in de loop van het proces en die moleculair-genetische studies van de taalgenen bevatten. In deze fylogenetische studies werd de morfologie van de spraak- en taalorganen vergeleken. Op basis van deze vergelijking beschreven de onderzoekers de taalontwikkeling beginnend met de protozoa en tenslotte met de recente mens. De menselijke taalgenen zijn vergeleken met die van andere dieren, zoals muizen, zangvogels en micro-organismen.
Het belangrijkste doel van de fylogenetische studies was om het begrip van de menselijke taal te verbeteren. Naast de vraag waar taal nodig is en de grenzen van taalprestaties, rezen epistemologische vragen. Fylogenese geeft het antwoord op het laatste dat een soort slechts zoveel van de waarheid kent als verenigbaar is met het voortbestaan van de soort.
In de fylogenetische vergelijkingen van de morfologie van spraak- en taalorganen werd de menselijke taal vooral vergeleken met die van de chimpansee. Omdat de chimpansee naast een ver naar voren gelegen kaak, een nogal onregelmatig gebit en een platte keel heeft, is articulatie in de richting van de menselijke taal voor hem moeilijk. Genetisch gezien hebben mensen en chimpansees bijna dezelfde genen voor spraakmotoriek. De chimpansee is ook geschikter dan welke andere soort dan ook voor de cognitieve neigingen van de menselijke taal.
Naast dit en soortgelijke fylogenetische onderzoeken omvat de huidige embryologie bijvoorbeeld ook fylogenetische vragen. De belangrijkste vraag op dit gebied is of de ontwikkeling van een individueel organisme kan worden opgevat als een weerspiegeling van de stamgeschiedenis. Hierbij spelen structuren zoals de faryngeale bogen van het menselijke embryo een rol, die vanuit fylogenetisch oogpunt waarschijnlijk overeenkomen met relikwieën van kenmerken van de voorouderlijke voorouders en dus bijvoorbeeld kunnen worden vergeleken met de kieuwen van vissen.
Causale verbanden tussen fylogenie en ontogenie zijn een relevant onderzoeksgebied in de embryologie. In dit onderzoeksgebied onderzoekt fylogenese bijvoorbeeld de vraag of genetische controle- en ontwikkelingsgenen of embryonale vormingsprincipes en -mechanismen begrepen kunnen worden als het centrale aanvalspunt voor mechanismen van evolutie of soortverandering.
Ziekten en aandoeningen
In wezen lijden individuen met een ontogenie met sterke afwijkingen van de fylogenie meestal aan een ziekte. Fylogenetische onderzoeken vinden soms ook plaats met betrekking tot bepaalde ziekten zelf en proberen in dit geval de geschiedenis van een bepaalde ziekte bij een bepaalde soort en de mogelijke aanpassingen van de soort als gevolg daarvan te begrijpen. Een voorbeeld van een ziekte waarvoor fylogenetische studies bestaan, is het HIV-virus. De fylogenetische analyse van de virale ziekte suggereert dat het HIV-virus driemaal of zelfs meer dan driemaal volledig onafhankelijk van elkaar van een dier, zoals een aap, op een menselijk individu is overgegaan. Met behulp van de moleculaire klok 2 kan een tijdsbestek tussen 1930 en 1940 worden bepaald, met Afrika als het oorspronkelijke land. Deze conclusies zouden kunnen worden getrokken door de fylogenese van verschillende varianten van het HIV-virus te reconstrueren.
Ziekten van welke aard dan ook worden onderzocht op hun geschiedenis bij de menselijke soort met behulp van een fylogenetische analyse. Als er bijvoorbeeld een lange geschiedenis is van bepaalde ziekten bij een bepaalde stam, passen gastheer en kiem zich steeds meer aan elkaar aan.
Fylogenetische overwegingen zijn de focus geworden van onderzoek, niet alleen naar ziekten, maar ook naar menselijke lichaamsprocessen zoals hoesten. In dit geval bewijst fylogenese dat de vitale functies van slikken, braken en ademen bij alle gewervelde dieren moesten worden beschermd door reflexen vanwege de kieuwdarm, omdat ze gemakkelijk kunnen worden verwisseld door de anatomische structuren. Vissen spugen storende deeltjes of niet-eetbare items uit de kieuwmand door middel van een sterke samentrekking van de keelholte door de mond. Gewervelde landdieren hebben een scheiding tussen de functies hoesten en spugen. De longen en keel van deze levende wezens worden door hoesten vrijgemaakt van deeltjes. De slokdarm en maag zijn daarentegen afhankelijk van spugen. Landbeestjes maken hun neus schoon door te niezen.